Nama Yogyakarta berasal dari kata Ngayogyokarto. Kata Ngayogyokarto sendiri diambil dari kosakata jawa yakni Ngayogyo dan Karto. Ngayogyo berarti baik atau pantas dan Karto artinya aman sejahtera. Ngayogyokarto mempunyai makna mencapai kesejahteraan.
Nama Ngayogyokarto diciptakan oleh paman buyut pendiri keraton Ngayogyokarto Hadiningrat yaitu Paku Buwono I. Namun resmi dipakai setelah Kasultanan Ngayogyokarto berdiri. Kasultanan Ngayogyokarto didirikan oleh Pangeran Mangkubumi yang kemudian memiliki gelar Sri Sultan Hamengkubuwono I. Hingga kini tampuk kekuasaan Kasultanan Yogyakarta masih terus diwariskan oleh penerus-penerusnya. Saat ini Kasultanan Yogyakarta dipimpin oleh Sri Sultan Hamengkubuwono X yang sekaligus menjabat gubernur Daerah Istimewa Yogyakarta.a